Der Schwerpunkt seiner Forschung liegt im der Informations - und Geschäftsprozessmanagement. Im Rahmen seiner Forschung er 1984 den Spin-off seines Instituts die IDS AG. Er ist Hauptgesellschafter und Aufsichtsratsvorsitzender.
Er war mehrfach Mitglied des Aufsichtsrats SAP AG .
Er schuf die wissenschaftliche Grundlage für ARIS -Konzept. Das darauf basierende ARIS-Toolset wird von IDS Scheer vertrieben.
Scheer fördert die Kultur insbesondere Jazz hat ein unverkennbares Selbstvermarktungstalent.