BLAST-Algorithmus

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Der BLAST-Algorithums ( B asic L ocal A lignment S earch T ool) ist ein Verfahren zum Vergleich von Proteinen .

Er basiert auf der Levenstein-Distanz und ist ein lineares Optimierungsverfahren um Pattern Matching zu ermöglichen. Dies ermöglich eine Mustererkennung womit Gensequenzen verglichen werden können.

Man kann zwischen dem Vergleich der DNA-Sequenz und der Aminosäure-Sequenz wählen.

Weblinks

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/ - BLAST Suche beim NIH

Bücher zum Thema BLAST-Algorithmus

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