1991 beschloss er als Präsident zu kandidieren. der gesamten Wahlkampfzeit lag Clinton nicht zuletzt wegen seiner Anknüpfung am historischen Mythos des früheren Präsidenten John F. Kennedy mit deutlichem Vorsprung in Führung.
Bei den Präsidentschaftswahlen vom 3. November 1992 gewann Clinton mit 43 % vor amtierenden George H. W. Bush (38 %) dem unabhängigen Kandidaten Ross Perot (19 %). zog daraufhin am 20. Januar 1993 als 42. Präsident der Vereinigten Staaten Amerika ins Weiße Haus ein.
Clintons vorrangigste Ziele während seiner Amtszeit die Einführung der Krankenversicherung die Aussöhnung mit Vietnam die Bekämpfung von Drogenmissbrauch Waffengewalt und Armut in den USA und in der Welt . Vor allem aber hatte sich Clinton Aufgabe verschrieben die von seinen Amtsvorgängern Ronald und George Bush hinterlassene höchste Staatsverschuldung in Geschichte der USA sowie jährliche Haushaltsdefizite von 200 Milliarden Dollar abzubauen. Außenpolitisch bemühte er um eine Aussöhnung zwischen Israel und den Palästinensern . Der Nato -Einsatz gegen Jugoslawien 1999 wurde von Clinton maßgeblich mitentschieden.
Die Präsidentschaftswahl 1996 gewann er mit 50 % der klar gegen seinen republikanischen Herausforderer Bob Dole (41 %) sowie den unabhängigen Kandidaten Perot (8 %) und wurde somit im bestätigt. Die zweite Amtszeit wurde allerdings durch eine Affäre mit Monica Lewinsky überschattet er konnte aber seine Präsidentschaft 20. Januar 2001 als einer der erfolgreichsten Präsidenten abschließen.
Seit dem Tag seines Ausscheidens aus Amt gehört seine Ehefrau Hillary dem US-Senat