Die Braunalgen (Phaeophycota) bilden eine eigene Abteilung innerhalb Protisten (Protista) und werden in die Gruppe Stramenopilen (Stramenopila) eingeteilt zu der unter anderem die Kieselalgen (Bacillariophyta) und die Goldalgen (Chrysophyta) gehören. handelt sich um meist marine oft braune Algen .
Ein Kennzeichen dieser fädig oder blattartigen jeden Fall meist mehrzelligen Protisten sind die Fucoxanthin-Farbstoffe die das grüne Chlorophyll maskieren also überdecken.
Die Systematik der Braunalgen ist derzeit stabil. Meist unterscheidet man eine Klasse Phaeophyceae einer je nach Autor unterschiedlichen Zahl an Im folgenden werden einige davon aufgeführt.