Fanny Koen begann erst im Alter 16 Jahren mit der Leichtathletik. Ihr Trainer Blankers ein ehemaliger Dreispringer erkannte ihr vielseitiges Talent. Mit 18 nahm sie 1936 an den Olympischen Sommerspielen in Berlin teil. Dort belegte sie Hochsprungwettbewerb den 5. Platz. Mit der niederländischen x 100 m-Staffel wurde sie ebenfalls 5.
Fanny Blankers-Koen gilt als eine der Leichtathletinnen aller Zeiten. Während ihrer aktiven Zeit sie 21 Weltrekorde in sechs verschiedenen Disziplinen 1999 wählte der Internationale Leichtathletik-Verband Blankers-Koen zur Leichtathletin des Jahrhunderts .
Fanny Blankers-Koen litt an Altersdemenz und verbrachte ihre letzten Lebensjahre in Pflegeheim in Hoofddorp wo sie am 25. 2004 im Alter von 85 Jahren verstarb.