1937 verließ Joliot-Curie das Institut du Radium wurde zum Professor am Collège de France Nach der deutschen Besetzung Frankreichs 1940 nahm er in der Resistance aktiv am Widerstand teil und schmuggelte Forschungsergebnisse zur Kernspaltung nach England. 1941 wurde er Präsident der Front National. der Besatzung stand er der französischen kommunistischen nahe.
Nach dem Krieg wurde Joliot-Curie Direktor Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) 1946 Hochkommissar für Atomenergie im neugegründeten Commissariat l'Energie atomique (CEA) und leitete 1948 den Bau des ersten französischen Atommeilers. politischen Gründen musste er 1950 diese Positionen abgeben.
Nach dem Tod seiner Frau 1956 beschäftigte er sich in den letzten Lebensjahren hauptsächlich mit dem Aufbau des Instituts Kernphysik in Orsay.