Als Journalist arbeitet Aly unter anderem Redakteur bei der taz der Berliner Zeitung und bei der FAZ .
Aktuell hat Götz Aly eine Gastprofessor interdisziplinäre Holocaustforschung am Fritz Bauer Institut in Frankfurt am Main für 2004/2005 inne.
Hauptthema von Götz Alys Forschung ist Geschichte des Holocausts und die Beteiligung gesellschaftlicher Eliten an Vernichtungspolitik im Nationalsozialismus . Dabei arbeitet Aly weitgehend außerhalb des Wissenschaftsbetriebs und schafft es so seine Unabhängigkeit sichern.
Für seine Arbeit ist Aly mehrfach worden 2002 erhielt er den Heinrich-Mann-Preis 2003 den Marion-Samuel-Preis der "Stiftung Erinnerung".
Wer sich jedoch den Einzelheiten den angeblichen des Vergangenen aussetzt gerät in einen menschlichen der die eigenen Gewissheiten ständig gefährdet. Geschichte Demut und hält nur die eine Lehre Niemand steht auf der sicheren Seite. (aus: Rasse und Klasse )