Einer Legende nach soll der Erbauer Burg Radbot auf einem Jagdausflug das Schloss Habichtsburg benannt haben als sich ein Habicht auf dem Schlossgemäuer niederliess. Wahrscheinlich wurde jedoch nach dem altdeutschen Wort 'hab'/'haw' als Bezeichnung für 'Flussübergang' benannt. Dies verweist auf Funktion der Burg die Furt von Altenburg (heute zu Brugg Schweiz) zu bewachen.
Die Burg wurde um 1020 von Radbot und seinem Bruder Werner Straßburg erbaut. Mit der Verlagerung der habsburgischen gegen Osten verlor sie ihre Bedeutung und 1415 an die Eidgenossen verloren.
Danach wurde die Burg von ihren wechselnden Besitzern vernachlässigt bis sie 1803 an den Kanton Aargau überging welcher Renovationen vornehmen ließ.