Von 1677 bis zu seinem Tode war Schelle Thomaskantor in Leipzig als Nachfolger von Sebastian Knüpfer und von Johann Kuhnau . In dieser Eigenschaft schrieb er vor vokal-instrumentale Kirchenmusik.
Schelles Schaffen wurde anfangs wesentlich von Heinrich Schütz beeinflusst. Seinerseits war er Lehrer von Johann Theodor Roemhildt Friedrich Wilhelm Zachow Reinhard Keiser Christoph Graupner und Johann David Heinichen.
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