Aflaq wurde in eine griechisch-orthodoxe Familie In den frühen dreißiger Jahren studierte er der Sorbonne in Paris . 1940 gründete er zusammen mit Salah al-Din al-Bitar die Ba'ath-Partei . 1949 wurde er für kurze Zeit Erziehungsminister. Er floh 1952 vor dem neuen in Syrien in den Libanon von wo er 1954 wieder zurückkehrte. der arabischen Niederlage im Sechs-Tage-Krieg 1967 emigrierte er nach Brasilien . 1974 ging er nach Bagdad wo er zwar hochgeachtet war jedoch wirklichen Einfluss blieb.