Am Tag seiner Geburt wurde er König von Rom ausgerufen. Nach dem Rücktritt des Kaisers Bonaparte wurde der König von Rom umgehend Anhängern seines Vaters zu dessen Nachfolger zum Napoleon II. erklärt. Nach der Verbannung Napoléon Bonapartes nach Elba floh Erzherzogin Marie Louise mit ihrem zu ihrem Vater Kaiser Franz I. nach Wien . Im Zuge des Wiener Kongresses wurde beschlossen dass die ehemalige Kaiserin Louise den Titel einer Herzogin von Parma und ihr Sohn Franz den Titel Prinzen von Parma führen dürfen.
1817 wird dem Prinzen von Parma auf der Alliierten Russland und England der Titel aberkannt da er als Prinz von Parma gewesen wäre und einen Bonaparte auf einem Thron galt es nach Sicht der Siegermächte vermeiden. Sein Großvater Kaiser Franz I. schenkte die böhmische Provinzstadt Reichstadt (tschechisch: Zákupy ) und erhob diese zum Herzogtum woraufhin Franz als Herzog von Reichstadt bezeichnen durfte. Der Herzog hatte bereits mit Lungenproblemen zu kämpfen und erkrankte schließlich der Tuberkulose an der er am 22. Juli - erst 21-jährig - auf Schloss Schönbrunn in Wien starb. Er wurde in Wiener Kapuzinergruft bestattet und 1940 wurde sein nach Paris überführt.