Als die sudafrikanische Regierung begann ihre umzusetzen wurde Mphephu als Oberster Häuptling des der Venda am 1. Juni 1971 zunächst Chief Minister zweier unzusammenhängender Territorien. der Entlassung des Landes in die formelle von Südafrika am 13. September 1979 erhielt er den Titel des Präsidenten.
Als Präsident war er zugleich Vorsitzender Venda National Party der einzigen in Venda Partei.