Während seines Pontifikats kam das Schisma des Hippolytus zu seinem Ende. Pontian andere Kirchenführer darunter auch Hippolytus wurde von Maximinus Thrax nach Sardinien ins Exil geschickt. Aufgrund dieser Strafe Pontian am 25. September 235 zurück. Es ist unbekannt wie lange im Exil blieb aber laut des Liber Pontificalis verstarb er aufgrund der unmenschlichen Behandlung er in den Minen von Sardinien erfuhr. Überreste wurde von Papst Fabianus nach Rom überführt und in den Katakomben von Kalixt I. begraben.