1803 wurde der "Baierische Provinz Schwaben" eine Landesdirektion in Ulm aus allen schwäbischen die durch den Reichsdeputationshauptschluss an Bayern fielen. 1808 wurde diese drei Kreise untergliedert (Oberdonaukreis Lechkreis Illerkreis) die zum Oberdonaukreis mit Verwaltungssitz Augsburg vereinigt wurden. wurde dieser in Kreis Schwaben und Neuburg wobei Neuburg an der Donau neu zum kamen Aichach Friedberg und Rain aber an fielen. Rain kam 1879 wieder an den 1939 wurde der Kreis in Regierungsbezirk Schwaben an den 1944 Friedberg fiel. Lindau war aus dem Regierungsbezirk ausgegliedert da es Teil französische Besatzungszone war. 1972 fielen Stadt und Neuburg a.d. Donau sowie die Fuchstalgemeinden des Landkreises Kaufbeuren an Oberbayern und der Hauptteil ehemaligen Landkreises Aichach an Schwaben.
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