Als Fürst-Erzbistum entwickelte sich zu einem Pufferstaat zwischen Bayern und den Habsburger Landen. 1462 und 1525 /26 kam es zu Bauernaufständen. Fürstbischof Leopold Anton Graf Firmian erzwang 1731 /32 die Auswanderung von rund 20.000 Protestanten. 1803 kam das Fürstentum als säkularisiertes Kurfürstentum an den Großherzog Ferdinand III Toskana 1805 mit Berchtesgaden zu Österreich. 1810 kam es zu Bayern 1816 (nach dem Wiener Kongress ) kam es ohne Berchtesgaden und den Flachgau wieder zu Österreich. 1849 wurde es österreichisches Kronland 1920 Bundesland. Das kirchliche Erzbistum selbst wurde 1807 auf das Gebiet des Landes Salzburg das östliche Nordtirol beschränkt und in diesem 1818 und 1825 neu organisiert.