Das Stadtwappen zeigt in Rot eine silberne Burg mit blauem Dach und vier Turmknäufen im offenen Tor einen gespaltenen Schild vorn in Gold eine schwarze Henne mit Kamm und roten Lappen auf grünen Dreiberg in Blau einen neunmal von Silber und geteilten golden gekrönten Löwen.
Der Inhalt des Schildes (Henne und geht auf die geschichtliche Entwicklung der Stadt der Zeit von 1360 bis 1583 zurück. dieser Zeit lebte die Stadt Schmalkalden in Kondominat (Doppelherrschaft) zwischen der Landgrafschaft Hessen-Kassel und gefürsteten Grafschaft Henneberg. Als im Jahre 1583 Georg Ernst von Henneberg kinderlos starb fielen Henneberger Besitzungen an Landgraf Wilhelm IV von
Auf Beschluss der Kabinettsitzung der Landesregierung 16.03.2004 bekam Schmalkalden die Bezeichnung "Hochschulstadt" verliehen. Stadt ist berechtigt diese Bezeichnung mit Wirkung 01.05.2004 zu führen.