Die Kirche wurde beim Luftangriff am 4. Dezember 1943 schwer beschädigt doch sind diese Schäden beseitigt. Anlässlich des Bachjahres 1950 wurden die Gebeine Bachs der hier 1723 bis zu seinem Tode 1750 Thomaskantor war aus der zerstörten Johanniskirche
Der Thomanerchor wurde 1212 gegründet und ist somit einer der Knabenchöre Deutschlands. Im Laufe der Geschichte bekleideten wieder bedeutende Komponisten und ausübende Musiker das Amt des Thomaskantors .
Vor der Thomaskirche steht ein Denkmal Johann Sebastian Bach des Bildhauers Carl Seffner 1908 ). Ein weiteres Denkmal das mit Unterstützung Felix Mendelssohn Bartholdys 1843 geschaffen wurde steht in den nahe Anlagen.