Er schrieb: "Religio medici" (Lond. 1642; Ausg. das. 1881) eine Art philosophischen Glaubensbekenntnisses durch Originalität und Gelehrsamkeit welches ihm den des Atheismus zuzog; ferner "Pseudodoxia epidemica or on vulgar errors" (das. 1646 neue Aufl. worin er die zu seiner Zeit verbreitetsten widerlegte; "Miscellany tracts" (das. 1684); "Posthumous works" 1712) und eine Sammlung von Aphorismen betitelt: morals" (Cambr. 1716; neue Ausg. Lond. 1863).
Eine Gesamtausgabe seiner Werke besorgte Wilkin 1851-52 3 Bde. ). Sein Leben beschrieb Johnson.