Er ist seit 1974 Mitglied im bayerischen Landtag und seit 1991 Mitglied des CSU-Parteivorstands.
Im Herbst 2003 wurde Thomas Goppel Markus Söder als Generalsekretär der CSU abgelöst. Heute ist er Staatsminister für Forschung und Kunst im bayerischen Kabinett.
Bereits zum zweiten Mal wurde im März 2004 gegen ihn ein Verfahren wegen Fahrerflucht Goppel soll am 16. Februar 2004 in der Münchner Innenstadt mit einem anderen Wagen kollidiert und dessen Fahrer beleidigt haben. Die Staatsanwaltschaft formell die Aufhebung der Immunität Goppels beantragen. Erst dann kann ein eingeleitet werden.